La unidad de apoyo logístico y administrativo desempeña un papel crucial para garantizar la eficiencia y transparencia en sus funciones. Inicialmente, se encarga de diseñar y aplicar políticas administrativas aprobadas por la Dirección General, abarcando la difusión y aplicación de reglamentos vinculados a la gestión de bienes, servicios, personal y organización administrativa. Además de atender oportunamente solicitudes de contratación y consultorías, brinda asistencia técnica y supervisa procesos internos para asegurar el cumplimiento de normativas.

La unidad también supervisa tecnologías, como sistemas informáticos, y respalda técnicamente activos utilizados en la lucha contra el narcotráfico. Su labor abarca la planificación, organización y supervisión de actividades técnicas y operativas, la implementación de subsistemas, coordinación administrativa con regionales y distritales, y ejecución de tareas administrativas relacionadas con contratación, manejo y disposición de bienes. Además, asume otras funciones delegadas por superiores y la MAE.